Здравствуйте, Валерий.
Разделите для себя ч. 1 и 2 на «отгрузку» и «предоплату». Суммы поступившей предоплаты Вы закрываете в гр. 22 и 23 актами выполненных работ. Если Акт на большую сумму, чем предоплата, то остаток акта переносите в раздел «отгрузка». И уже в части «отгрузка» будете закрывать остаток акта выполненных работ последующими оплатами.
И так далее.
Если уж совсем непонятно, то заполните пару операций и приходите на прием, проверю.