Здравствуйте, Елена!
Относительной легализации не бывает. Она либо есть, либо её нет.
Да, фирма может взять у физического лица в безвозмездное или возмездное пользование компьютер и может официально нести расходы по его ремонту, настройке и т.п.
Но, как я
уже говорила, официально проводить оплату услуг программиста по настройке пиратской копии 1С (и тем самым «светить» наличие у Вас этой копии) — очень неразумно и неосмотрительно. Напишите в договоре с программистом нечто иное (ремонт ПК, настройка сети и т.п.).
В качестве занимательной литературы по теме рекомендую
вот это. А также
это и
это.