Уважаемый Дмитрий!
В соответствии со ст. 310
Гражданского кодекса Республики Беларусь,
"исполнение обязательств может обеспечиваться неустойкой, залогом, удержанием имущества должника, поручительством, гарантией, банковской гарантией, задатком и другими способами, предусмотренными законодательством или договором."Таким образом, законодательство не запрещает использования такого способа обеспечения обязательств (в данном случае - обязательств по уплате арендных платежей), как внесение некоего "обеспечительного взноса".
Однако, как Вы правильно предполагаете, составление и оплата документов, ссылающихся на несуществующий договор, противоречит логике.
Вначале должен заключаться договор аренды, и только после этого могут составляться и оплачиваться какие-либо счет-фактуры, касающиеся данного договора.
К договору должен прилагаться расчет арендной платы (если он не сделан в самом тексте договора) и акт приемки-передачи помещения в аренду. Также к договору может прилагаться план помещения (но если в договоре четко оговорены идентификационные данные помещения - прилагать план не обязательно).
Если арендодатель утверждает, что "обеспечительный взнос зачтется в счет арендной платы" -
порядок зачета должен быть подробно прописан в договоре.
Вполне возможно, что арендодатель действительно назавтра отдал бы Вам договор, оформленный той же датой, что и счет-фактуры, и всё было бы в порядке.
Но всё же я категорически не рекомендую что-либо оплачивать до подписания договора. Например, может так оказаться, что в договоре аренды в итоге будет указана совсем не та сумма арендной платы, которую Вам обещали указать (такие случаи действительно бывают), либо могут содержаться иные невыгодные для Вас условия.