Здравствуйте, Виктория Андреевна!
При реорганизации трудовые отношения с работником (с согласия работника) продолжаются. Если работник не согласен работать в ООО — тогда его можно уволить (п. 5 ст. 35 ТК). Если хочет остаться работать в ООО — просто так Вы его не уволите, нужны основания (прогул, систематическое неисполнение обязанностей, сокращение штата и т.п. В общем, всё как обычно).