Здравствуйте, Александр!
В отношении вопросов исчисления зарплаты, ФСЗН, страховых взносов, предоставления отчетности по работникам — лучше уточните у
бухгалтера.
P.S. Вы пишете, что трудоустроились в «госструктуру». Вот здесь могут быть нюансы, т.к. в некоторых случаях работникам «госструктур» запрещено быть ИП. Уточните, в какого рода госструктуре Вы работаете (государственный орган или предприятие с долей государственной собственности в уставном фонде (если да, то какой ее %), какого рода должность (руководящая или нет).