Здравствуйте, Анжелика!
1) Можно. Договор аренды на автомобиль в данном случае не обязателен. Но в договоре, заключаемом с ООО, нужно прописать то, что перевозчик будет использовать транспорт ООО.
2) 60240 Деятельность автомобильного грузового транспорта.
3) Пусть заключают. Только не учредители, а ООО в лице директора.
4) УСН или подоходный (на выбор).
При УСН — выручка, при подоходном - доход.
5) Уточните, о каких платёжках идет речь.
6) Можно от минимальной заработной платы, можно от фактического дохода (на выбор).