Уважаемый Андрей!
Да, Вы можете принять телефон в счет части оплаты, заключив указанное Вами доп. соглашение к договору, а также подписав акт приема-передачи телефона (в произвольной форме).
Акт закупки в таком случае не нужен, т.к. акт закупки составляется ИП при совершении сделки
купли-продажи с физ. лицом. А в Вашем случае телефон является не предметом купли-продажи, а
отступным (см.
ст. 380 ГК).