Здравствуйте, Евгений!
Да, можно.
Но есть некоторые исключения: лицо, являющееся ИП, не может работать по трудовому договору руководящим работником предприятия с долей госсобственности 50% и более, а также не может быть работником гос. организации, имеющим статус государственного служащего (и некоторые другие случаи).