Законно ли использовать такой способ оплаты за товар?

Здравствуйте, Сергей!
Полагаю, Вы работаете по договору комиссии (или поручения) и уплачиваете УСН с суммы вознаграждения (т.е. с разницы между полученными от клиента деньгами и Вашими расходами)?
Да, с одной стороны, законодательство не запрещает ИП использовать свои личные денежные средства (в том числе выведенные на карточку физлица) для закупки товаров. Но с другой стороны, при очередной проверке от Вас могут потребовать предоставить документы, подтверждающие произведённые Вами расходы на закупку товара для клиента (чтобы проверить, правильно ли Вы считали налогооблагаемую базу и есть ли у Вас подтверждающие расходы документы). Если из представленных Вами документов не будет чётко видно, что конкретно Вы покупали, то будут проблемы.