Здравствуйте, Антон!
Полагаю, что речь в данном случае Вы ведёте об отпуске без сохранения заработной платы. В этом случае зарплата ему не начисляется и не выплачивается, значит, и никаких связанных с ней платежей нет.
Но задайтесь вопросом, выпадает ли на период пребывания директора в отпуске без сохранения заработной платы необходимость представления отчётности? И если да, то кто будет её представлять?