«Клион-Д 100» противопоказан к применению в I триместре беременности. Применение препарата во II и III триместрах возможно только в тех случаях, когда предполагаемая польза для матери превосходит потенциальный риск для плода.
Метронидазол выделяется с грудным молоком. В период грудного вскармливания применение «Клиона-Д 100» противопоказано. При необходимости применения препарата в период лактации следует прекратить грудное вскармливание.