Университет ведет свою деятельность с 1934 года. Первоначально учреждение было рассчитано на обучение 250 человек. В настоящее время в стенах университета получают знания около 6 тысяч слушателей и студентов. Среди них более 500 человек — приезжие из 30 стран мира, получающие образование на факультете подготовки иностранных граждан.
На территории учебного заведения располагается ботанический сад и учебно-производственная аптека. Университет издает 4 научно-практических журнала и многотиражную газету «Медвузовец».
При университете работают: клиника ВГМУ, клиника стоматологического факультета, 2 аптеки, контрольно-аналитическая лаборатория. Учреждение оказывает ряд платных медицинских услуг по государственным расценкам.
При вузе работает музей истории ВГМУ. Ведут работу студенческий и спортивный клубы, объединяющие 14 творческих коллективов и 15 физкультурных секций.
Степени, присваиваемые по окончании ВГМУ, признаны Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ), Образовательной Комиссией по иностранным медицинским дипломированным специалистам (ECFMG, Филадельфия, США), Литовским центром по оценке качества высшего образования (Литва), Министерством просвещения и высшего образования (Республика Ливан), Федеративной службой проверки дипломов (FCVS, Даллас, США), Медицинскими Советами Индии, Шри-Ланки, Ирландии и т.д.