Добрый день, Игорь!
Всё именно так, как Вы написали. Услуги по упаковке — единый, а торговля в розницу — УСН 3%. Но это ой как не выгодно, два налога. Причём, если УСН нужно заплатить раз в квартал из выручки, то единый — до начала месяца. А будет выручка от упаковки или нет — неизвестно (в Витебске — 800 000 рублей).
Мой совет: услуги по упаковке оформляйте реализацией товара, например, обёрточной бумаги, которая будет стоить с учётом услуги по упаковыванию в неё. Тогда налог будет УСН 3%.
С уважением, ЧП «ЛюксБаланс»