Добрый день, Алёна!
Если это действительно Ваш работник, и направляется он на обучение (семинар), связанное с выполнением его трудовых обязанностей, то никаких налогов удерживать не нужно. Направляете работника в командировку, выплачиваете суточные и другие расходы в соответствии с законодательством.
С уважением, ЧП «ЛюксБаланс»