Что делать ИП, если он неправомерно применял вычет на наёмного работника?

Здравствуйте.

Подскажите, пожалуйста, как поступить в данной ситуации: ИП приняла пенсионера на работу, при приёме он не представил трудовую книжку, ссылаясь на то, что она осталась далеко от города проживания, но он её привезёт (прописан он действительно не близко к городу работы). Потом как-то забыла о ней.

Через 8 мес. он говорит, что хочет уволиться, и просит рассчитать отпускные, все документы подписаны. Прошу у него трудовую, а он говорит, что трудовую не принесёт, т.к. она на другом месте работы.

Подоходный с з/п платила с учётом вычета 730 000 (номер и серия трудовой у меня есть, он принёс ксерокопию титульного листа).

Как мне поступить, ведь вычет не должен применяться, и подоходный не уплачен в полном объёме?