Как посчитать больничный для работающего по договору подряда?

Здравствуйте, человек работающий у нас по договору подряда с 21.11.16 по 31.12.16 ушёл на б/л в декабре, программа у нас не 1С, и ничего толком не отслеживалось ни в бухгалтерии, ни в отделе кадров, только сейчас заметила, что договор подряда пишут с 21.11.2016 по 31.12.2016. А в первом акте выполненных работ закрывают с 01.11.2016 по 30.11.2016. А в ПУ-3 за прошлые года все договоры указывают с 1 числа.

На что будет правильней смотреть: на договор подряда или акт выполненных работ, чтобы знать на сколько календарных дней делить для исчисления б/л за декабрь? И насколько серьезно является ошибкой про ПУ-3?

Спасибо.