Будет ли возмещение по топливо облагаться подоходным налогом?

Добрый день, Наталья!

Полагаю, что если личный автомобиль ИП будет использоваться им самим, а не иным сотрудником вашей организации. То данные выплаты производятся в рамках договора управления и должны облагаться налогом у самого ИП. Сам же ИП при расчёте своего налога сможет учесть эти выплаты в составе своих затрат (если позволяет выбранная им система налогообложения). Следовательно, указанные выплаты ИП должен предусмотреть в договоре с вашей организацией, отразить в акте оказанных услуг.

В связи с вышеизложеным, если личный автомобиль ИП будет использоваться им самим, а не иным сотрудником вашей организации, то оформить личный автомобиль ИП на ООО и списывать топливо на затраты нет оснований. Однако, в сумму затрат ООО включит акт от ИП-управляющего, увеличенный на сумму израсходованного им топлива.

Советую вам, с учётом моих подсказок, обратиться за налоговой консультацией в МНС и задать свой вопрос в МНС на сайте МНС в разделе Электронные обращения.