оплата переработанных часов

Здравствуйте, Екатерина!
Система оплаты труда устанавливается нанимателем. Бывают разные системы оплаты труда и, не видя всех документов, невозможно сделать однозначный вывод о правильности действий нанимателя.
Из Вашего вопроса можно сделать вывод о том, что у Вас в организации введён суммированный учёт рабочего времени с учётным периодом квартал (это возможно). Однако мне представляется нарушением то, что Вам не установлена тарифная ставка (оклад). Ведь от них должны рассчитываться доплата за работу в ночное время (а не МЗП), величина оплаты простоев, повышенный размер оплаты за работу сверхурочно, в выходные и праздничные дни. Таким образом, тарифная ставка (оклад) необходимы. Если работник не работал весь месяц по каким-либо причинам (отпуск, болезнь и т.д.), для него в этом месяце должна быть рассчитана индивидуальная норма рабочего времени, которая не включает эти периоды отсутствия и его выходные по режиму рабочего времени (об оплате за работу в выходные смотрите ответ на вопрос №124). Сверхурочной работой считается работа сверх установленной нормы рабочего времени в тот день, который изначально установлен режимом рабочего времени работнику как рабочий (в Вашем случае, видимо, графиком работ (сменности)).
Каждый час работы в сверхурочное время оплачивается работникам со сдельной оплатой труда — не ниже двойных сдельных расценок. По договорённости с нанимателем работнику за работу в сверхурочное время может предоставляться другой день отдыха (из расчёта один день за каждые 8 часов сверхурочной работы). В случае предоставления другого дня отдыха оплата за работу в сверхурочное время производится в одинарном размере.
Для того, чтобы разрешить Ваши сомнения, Вам необходимо обратиться за консультацией к экономистам по заработной плате в Комитет по труду, занятости и социальной защите Витебского облисполкома по ул. Правды, 32 в г. Витебске с трудовым договором (контрактом), расчётными листками.