Здравствуйте, Виктория!
Я полагаю, что в Вашем случае пособие по временной нетрудоспособности будет выплачено в обычном порядке (так как нетрудоспособность начнётся ещё в период работы). Назначение пособия по общему правилу производится в течении 10 дней со дня обращения за ним.
В случае невыплаты и за более детальной консультацией Вам целесообразно обратиться в районное отделение Фонда социальной защиты населения по месту регистрации нанимателя.