По какой ставке ООО доплатить налог? 

Доброе утро!

Речь идет об ООО, УСН без НДС, комиссионная торговля. Сейчас находится в стадии ликвидации, идёт налоговая проверка. Эту фирму я обслуживала как ИП, оказывающая услуги по ведению бухучета в 2014 году. Первичку привозил директор, я её обрабатывала и вносила в КУДиР, рассчитывала налоги к уплате. После меня и этого директора сменилось 3 бухгалтера и 3 директора. Описи привезённых документов не составлялись.

Сейчас при проверке за самый первый месяц работы ООО появилась ТТН, которая мне в обработку не представлялась (я для себя вела по ним 1С, потому точно знаю). Поскольку наше ООО являлось комитентом, поэтому все приходные ТТН за месяц (выписанные комиссионером последним днём месяца на основании отчётов комитента) являются для него основанием для расчета его выручки от реализации. В этой ТТН даже суммы по калькуляции не идут, т. е. её надо было портить, но как-то «проворонили» и ТТН осталась. Фирма-комиссионер ликвидирована еще в 2016 году. На сумму комиссионного вознаграждения (неверно рассчитанного), указанного в этой ТТН, доначислили налог по УСН, но не по ставке 2014 г. — 3%, а по ставке — 5%.

И в налоговой заявили, раз этот период мой, то и все штрафы, все налоги и пени я должна уплатить как бухгалтер. Директор с которым я работала живёт за границей и его не найти.

1. По какой ставке ООО должно доплатить налог?
2. ООО еще существует, поэтому оно должно рассчитаться по неверно уплаченным налогам? Или я?

Благодарю за ответ заранее.